Metropolitan Police Department, Special Department, Special Violent Crime Countermeasures Division, Section 7, Tokunana File0

Ichinose Shiori og Mizuma Ruka, som er kullkamerater fra politihøgskolen, blir tildelt "Tokunana", en enhet organisert for å etterforske hendelser knyttet til den kriminelle organisasjonen "Nine", som planlegger å skape om verden. Selv om de ble fortalt at det var en elitegruppe med få medlemmer, viser det seg at Tokunana holder til i et rom som ligner et kott...?